The Bencao (Herbal) Database(本草数据库)
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miRNA Atlas
miR166
Bbj-miR166a
Accession:
B71130138
Entry
Homologs
Rfam Alignments
Targets
Entry
ID:
Bbj-miR166a
Alias:
F2.L000046.B3D*
Sequence:
UCGGACCAGGCUUCAUUCCCC
Description:
MIR166 putative
Species:
荜茄
  Species latin name:
-
TCM Name:
TCM Resource (Sample number):
荜茄(1)
Predicted by
Mirnovo
:
-
Evidence support:
Mirbase|infernal
Experimental status:
Yes
Homologs
miRBase Homologs
aly-miR166a-3p
;
aly-miR166b-3p
;
aly-miR166c-3p
;
aly-miR166d-3p
;
aly-miR166e-3p
;
aly-miR166f-3p
;
aly-miR166g-3p
;
aly-miR166h-3p
;
aof-miR166d
;
aqc-miR166b
;
aqc-miR166e
;
ata-miR166a-3p
;
ata-miR166b-3p
;
ata-miR166d-3p
;
ata-miR166e-3p
;
ath-miR166a-3p
;
ath-miR166b-3p
;
ath-miR166c
;
ath-miR166d
;
ath-miR166e-3p
;
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;
ath-miR166g
;
atr-miR166a
;
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;
atr-miR166d
;
bdi-miR166a-3p
;
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;
bdi-miR166c-3p
;
bdi-miR166d-3p
;
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;
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;
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;
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;
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;
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;
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;
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;
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;
fve-miR166a
;
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;
fve-miR166e
;
fve-miR166f
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;
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;
gma-miR166b
;
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;
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;
gma-miR166e
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gma-miR166f
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gma-miR166g
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;
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;
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lus-miR166h
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;
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;
mdm-miR166b
;
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;
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;
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;
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;
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;
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;
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;
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;
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;
mes-miR166e
;
mes-miR166f
;
mes-miR166g
;
mtr-miR166a
;
mtr-miR166e-3p
;
mtr-miR166g-3p
;
nta-miR166a
;
nta-miR166b
;
nta-miR166c
;
nta-miR166d
;
nta-miR166e
;
nta-miR166f
;
nta-miR166g
;
nta-miR166h
;
osa-miR166a-3p
;
osa-miR166b-3p
;
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;
osa-miR166d-3p
;
osa-miR166f
;
osa-miR166j-3p
;
pab-miR166f
;
pab-miR166g
;
pab-miR166h
;
pab-miR166i
;
ppe-miR166a
;
ppe-miR166b
;
ppe-miR166c
;
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;
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;
ppt-miR166a
;
ppt-miR166b
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ppt-miR166c
;
ppt-miR166d
;
ppt-miR166e
;
ppt-miR166f
;
ppt-miR166g
;
ppt-miR166h
;
ppt-miR166i
;
pta-miR166a
;
pta-miR166b
;
ptc-miR166a
;
ptc-miR166b
;
ptc-miR166c
;
ptc-miR166d
;
ptc-miR166e
;
ptc-miR166f
;
ptc-miR166g
;
ptc-miR166h
;
ptc-miR166i
;
ptc-miR166j
;
ptc-miR166k
;
ptc-miR166l
;
ptc-miR166m
;
pvu-miR166a
;
rco-miR166a
;
rco-miR166b
;
rco-miR166c
;
rco-miR166d
;
rco-miR166e
;
sly-miR166a
;
sly-miR166b
;
smo-miR166a
;
smo-miR166b
;
smo-miR166c
;
ssl-miR166b
;
ssp-miR166
;
stu-miR166a-3p
;
stu-miR166c-3p
;
stu-miR166d-3p
;
tcc-miR166a
;
tcc-miR166d
;
vca-miR166a-3p
;
vca-miR166b-3p
;
vca-miR166c-3p
;
vvi-miR166c
;
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;
vvi-miR166e
;
vvi-miR166f
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vvi-miR166g
;
vvi-miR166h
;
zma-miR166a-3p
;
Bencao Homologs
Bbj-miR166a
;
Bjl-miR166a
;
Bsr-miR166a
;
Bswzz-miR166a
;
Btmz-miR166a
;
aan-miR166a
;
aar-miR166a
;
acn-miR166a
;
aco-miR166a
;
acr-miR166a
;
ade-miR166a
;
aeu-miR166a
;
agi-miR166
;
aha-miR166a
;
aju-miR166a
;
ala-miR166a
;
aof-miR166
;
aox-miR166a
;
apa-miR166a
;
apl-miR166a
;
asc-miR166a
;
ath-miR166a
;
att-miR166a
;
ave-miR166a
;
bca-miR166a
;
bch-miR166b
;
bci-miR166a
;
bhi-miR166a
;
bja-miR166a
;
bmj-miR166a
;
bpi-miR166a
;
cab-miR166a
;
car-miR166a
;
cas-miR166a
;
cau-miR166a
;
cba-miR166a
;
cci-miR166a
;
ccm-miR166a
;
cco-miR166aa
;
ccs-miR166aa
;
cde-miR166a
;
cfe-miR166a
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cga-miR166a
;
cid-miR166a
;
cit-miR166a
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cja-miR166a
;
cma-miR166
;
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;
cmj-miR166a
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cmn-miR166a
;
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;
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;
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cpe-miR166a
;
cpn-miR166
;
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;
cso-miR166a
;
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cst-miR166
;
csu-miR166a
;
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;
dda-miR166
;
dlo-miR166a
;
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;
dsu-miR166a
;
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;
epr-miR166aa
;
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;
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;
fsu-miR166a
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;
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;
hmu-miR166a
;
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;
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ija-miR166a
;
ili-miR166a
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;
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;
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;
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;
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;
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;
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;
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;
lji-miR166a
;
ljn-miR166a
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ljo-miR166a
;
ljp-miR166a
;
llc-miR166a
;
lln-miR166a
;
llu-miR166a
;
lpu-miR166aa
;
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;
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;
mch-miR166a
;
mda-miR166a
;
mpu-miR166
;
nca-miR166a
;
nja-miR166a
;
nnu-miR166aa
;
nsc-miR166a
;
nte-miR166a
;
ofi-miR166a
;
pas-miR166b
;
pav-miR166a
;
pca-miR166a
;
pci-miR166a
;
pcl-miR166a
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pcn-miR166a
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;
pgi-miR166a
;
pmu-miR166a
;
poe-miR166a
;
por-miR166a
;
ppr-miR166
;
psu-miR166a
;
ptn-miR166a
;
pvl-miR166aa
;
rcd-miR166a
;
rch-miR166aa
;
rcr-miR166a
;
rja-miR166a
;
rte-miR166a
;
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;
sad-miR166a
;
sar-miR166a
;
sba-miR166a
;
sbc-miR166a
;
sca-miR166a
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sch-miR166a
;
sdf-miR166a
;
sdi-miR166a
;
sgi-miR166a
;
sgl-miR166a
;
sjp-miR166a
;
sln-miR166
;
smi-miR166a
;
smn-miR166a
;
sor-miR166a
;
spo-miR166a
;
ssa-miR166a
;
sse-miR166a
;
ssu-miR166a
;
sto-miR166a
;
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;
tci-miR166a
;
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;
tja-miR166a
;
tmo-miR166a
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tru-miR166a
;
twi-miR166a
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vof-miR166a
;
vph-miR166a
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vtr-miR166d
;
vum-miR166a
;
zmu-miR166a
;
Rfam Alignments
>> mir-166  mir-166 microRNA precursor
 rank     E-value  score  bias mdl mdl from   mdl to       seq from      seq to       acc trunc   gc
 ----   --------- ------ ----- --- -------- --------    ----------- -----------      ---- ----- ----
  (1) !   5.9e-05   24.1   0.0  cm      101      121 ~~           1          21 + ~~ 1.00 5'&3' 0.62
                                                                ???  ??????  ????????      NC
                                                         ~~~~~~~>>>-->>>>>>-->>>>>>>>~~~~~ CS
                                             mir-166   1 <[100]*UCGGACCAGGCUUCAUUCCcC*[5]> 126
                                                                UCGGACCAGGCUUCAUUCCCC
                                         zmu-miR166a   1 <[  0]*UCGGACCAGGCUUCAUUCCCC*[0]> 21
                                                         .......*********************..... PP
Targets
Predicted by TargetFinder
NM_015221
;  
NR_148968
;  
Predicted by TAPIR
NM_015221
;  
NM_017811
;  
NR_148968
;